知識產權是高新企業認定四大評分指標之一，其重要程度不言而喻。
高新技術企業認定對企業知識產權采用分類評價方式，I類知識產權可以在下次認定時重復使用;II類知識產權僅限使用一次。其中：
1、Ⅰ類知識產權包含：發明 (含國防專利)、植物新品種、國家級農作物品種、國家新藥、國家一級中藥保護品種、集成電路布圖設計專有權。這類知識產權普遍獲取時間較長，但在申請評分上價值也更大。
2、Ⅱ類：實用新型、外觀設計、軟件著作權等，其中商標被明確規定不納入考慮。
以上知識產權必須申請在企業名下，在法人或股東名下的不能使用;同一個知識產權有多個權屬人的，只能由一個權屬人在申請時使用，其他企業則不能再用了。
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